Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms