Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLCO3A1Q9UIG8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms