Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNK4Q9NYG8 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms