Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPTSSAQ969W0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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