Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM41Q8WV44 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms