Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLD3Q8IV08 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms