Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNA2D4Q7Z3S7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNA2D4Q7Z3S7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms