Protein–RNA interactions for Protein: Q5QJU3

ACER2, Alkaline ceramidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER2Q5QJU3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACER2Q5QJU3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACER2Q5QJU3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms