Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FGD3Q5JSP0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms