Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RPL39P5Q59GN2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RPL39P5Q59GN2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms