Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
KRTAP20-2Q3LI61 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms