Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FOXF2Q12947 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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