Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POU5F1Q01860 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms