Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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FAM3AP98173 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FAM3AP98173 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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