Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGIRP43119 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGIRP43119 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGIRP43119 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGIRP43119 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGIRP43119 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGIRP43119 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGIRP43119 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGIRP43119 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms