Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZEB1P37275 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZEB1P37275 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms