Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB5P28074 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms