Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DENRO43583 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DENRO43583 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DENRO43583 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DENRO43583 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms