Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RCE1Q9Y256 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RCE1Q9Y256 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms