Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KIAA1024Q9UPX6 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms