Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms