Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWV2

SPATA9, Spermatogenesis-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA9Q9BWV2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPATA9Q9BWV2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPATA9Q9BWV2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms