Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms