Protein–RNA interactions for Protein: Q99805

TM9SF2, Transmembrane 9 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF2Q99805 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF2Q99805 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF2Q99805 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM9SF2Q99805 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM9SF2Q99805 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms