Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
RNF185Q96GF1 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RNF185Q96GF1 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RNF185Q96GF1 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RNF185Q96GF1 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RNF185Q96GF1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RNF185Q96GF1 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RNF185Q96GF1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RNF185Q96GF1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RNF185Q96GF1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RNF185Q96GF1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
RNF185Q96GF1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RNF185Q96GF1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RNF185Q96GF1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RNF185Q96GF1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RNF185Q96GF1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RNF185Q96GF1 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
RNF185Q96GF1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
RNF185Q96GF1 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RNF185Q96GF1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RNF185Q96GF1 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RNF185Q96GF1 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RNF185Q96GF1 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RNF185Q96GF1 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RNF185Q96GF1 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RNF185Q96GF1 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
RNF185Q96GF1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RNF185Q96GF1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RNF185Q96GF1 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RNF185Q96GF1 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RNF185Q96GF1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
RNF185Q96GF1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms