Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms