Protein–RNA interactions for Protein: Q969D9

TSLP, Thymic stromal lymphopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSLPQ969D9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TSLPQ969D9 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSLPQ969D9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms