Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms