Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms