Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FHOD3Q2V2M9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms