Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC142Q17RM4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC142Q17RM4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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