Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDCD2Q16342 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms