Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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