Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 C14orf119-201ENST00000319074 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.362e-7■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 ABCF2-201ENST00000222388 2185 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.167e-11■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 ABCF2-202ENST00000287844 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.887e-11■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 HM13-206ENST00000460389 1075 ntTSL 517.16■□□□□ 0.348e-10■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.54e-7■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 27e-11■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.557e-11■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.027e-11■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 CALM1-206ENST00000553630 1420 ntTSL 520.55■□□□□ 0.887e-11■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.477e-11■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 CALM1-201ENST00000356978 4242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.217e-11■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.491e-6■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.941e-6■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 DDX56-208ENST00000467318 1665 ntTSL 517.17■□□□□ 0.342e-6■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.272e-6■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 DDX56-205ENST00000433257 1682 ntTSL 515.89■□□□□ 0.132e-6■■□□□ 12.6
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PABPC4Q13310 DDX56-212ENST00000485367 1781 ntTSL 512.76□□□□□ -0.372e-6■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 DDX56-203ENST00000421223 3028 ntTSL 212.19□□□□□ -0.462e-6■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 DDX56-211ENST00000479602 440 ntTSL 210.64□□□□□ -0.712e-6■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 IMPDH2-203ENST00000442157 865 ntTSL 211.54□□□□□ -0.561e-7■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.992e-10■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 PDCD10-208ENST00000473645 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.52e-10■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 PDCD10-218ENST00000497056 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.762e-10■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.082e-10■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 TFAP4-207ENST00000575672 1613 nt25.23■■□□□ 1.631e-7■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91e-7■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 TFAP4-206ENST00000575320 6491 ntTSL 215.61■□□□□ 0.091e-7■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 EIF3G-204ENST00000587681 537 ntTSL 29.94□□□□□ -0.821e-6■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 UQCRC1-204ENST00000460105 622 ntTSL 217.72■□□□□ 0.433e-7■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 NMU-204ENST00000509371 283 ntTSL 1 (best)4.07□□□□□ -1.763e-43■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.211e-9■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 RPL34-206ENST00000504231 629 ntTSL 1 (best)9.49□□□□□ -0.895e-46■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 PSMB3-209ENST00000614132 426 ntTSL 26.08□□□□□ -1.445e-15■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.194e-6■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.194e-6■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.286e-8■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.023e-12■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 HINT1-206ENST00000508495 825 ntTSL 1 (best)18.21■□□□□ 0.513e-12■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 HINT1-207ENST00000511475 923 ntTSL 312.54□□□□□ -0.43e-12■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 EIF1-202ENST00000462917 2170 ntTSL 1 (best)20.45■□□□□ 0.864e-15■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 EIF1-201ENST00000310837 1120 ntTSL 1 (best)10.59□□□□□ -0.714e-15■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.174e-15■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 EIF1-205ENST00000482111 1428 ntTSL 27.16□□□□□ -1.264e-15■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.754e-7■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 PSMG1-205ENST00000481921 716 ntTSL 26.28□□□□□ -1.42e-27■■□□□ 12.6
PABPC4Q13310 HSP90B1-207ENST00000550595 694 ntTSL 27.21□□□□□ -1.261e-11■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 FAM173A-203ENST00000564640 908 ntTSL 228.45■■■□□ 2.143e-6■■□□□ 12.5
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PABPC4Q13310 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.792e-9■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.742e-9■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 C1orf159-203ENST00000379325 2010 ntTSL 218.44■□□□□ 0.542e-9■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 C1orf159-211ENST00000465822 1933 ntTSL 217.78■□□□□ 0.442e-9■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 C1orf159-219ENST00000487177 3315 ntTSL 217.49■□□□□ 0.392e-9■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 C1orf159-216ENST00000477196 3214 ntTSL 214.9□□□□□ -0.022e-9■■□□□ 12.5
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PABPC4Q13310 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.691e-6■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.411e-6■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 VPS26A-203ENST00000395098 2554 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.031e-6■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.631e-6■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 EEF1D-253ENST00000534380 1001 ntTSL 516.3■□□□□ 0.23e-10■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.233e-10■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 CDC45-212ENST00000493724 469 ntTSL 215.73■□□□□ 0.113e-10■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -03e-10■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.13e-10■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 CDC45-203ENST00000407835 2090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.263e-10■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.774e-6■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.365e-6■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 IVNS1ABP-204ENST00000459929 3657 ntTSL 514.39□□□□□ -0.114e-6■■□□□ 12.5
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PABPC4Q13310 IVNS1ABP-207ENST00000480769 3776 ntTSL 1 (best)4.34□□□□□ -1.714e-6■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.868e-9■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 TBPL1-201ENST00000237264 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.718e-9■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 TBPL1-206ENST00000477527 634 ntTSL 56.55□□□□□ -1.368e-9■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.192e-14■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.724e-11■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.664e-11■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.622e-6■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.622e-6■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 AGBL5-209ENST00000487078 3261 ntTSL 1 (best)18.59■□□□□ 0.574e-11■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 DNAJC19-204ENST00000478723 935 ntTSL 218.35■□□□□ 0.532e-6■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 DNAJC19-202ENST00000469657 1239 ntTSL 218.11■□□□□ 0.492e-6■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.392e-6■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 AGBL5-205ENST00000441931 481 ntTSL 213.06□□□□□ -0.324e-11■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.382e-7■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 PCBP2-201ENST00000359282 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.152e-7■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 PCBP2-203ENST00000437231 3026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.492e-7■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 PCBP2-223ENST00000552819 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.532e-7■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 PCBP2-210ENST00000547859 1919 ntTSL 211.67□□□□□ -0.542e-7■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 PCBP2-205ENST00000447282 3077 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.612e-7■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 PCBP2-206ENST00000455667 2741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.682e-7■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 PCBP2-218ENST00000550585 2543 ntTSL 59.76□□□□□ -0.852e-7■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 PCBP2-209ENST00000547048 1696 ntTSL 27.57□□□□□ -1.22e-7■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.457e-9■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.657e-9■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 UQCRH-201ENST00000311672 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.184e-12■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 UQCRH-205ENST00000496387 674 ntTSL 1 (best)6.93□□□□□ -1.34e-12■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 UQCRH-204ENST00000489056 553 ntTSL 24.42□□□□□ -1.74e-12■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 PIH1D1-216ENST00000598889 615 ntTSL 522.66■■□□□ 1.227e-7■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 PIH1D1-221ENST00000601807 998 ntTSL 521.15■□□□□ 0.987e-7■■□□□ 12.5
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