Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms