Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ITGA3P26006 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA3P26006 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms