Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM21P19474 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms