Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.318e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AP1G1-212ENST00000566161 989 ntTSL 413.09□□□□□ -0.318e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AP1B1-207ENST00000421126 1908 ntTSL 513.08□□□□□ -0.318e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CDK5-201ENST00000297518 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.328e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 FLOT2-211ENST00000586827 1069 ntTSL 513.08□□□□□ -0.328e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AC099489.1-207ENST00000595170 3552 ntTSL 213.07□□□□□ -0.328e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 WDR11-211ENST00000605069 558 ntTSL 413.07□□□□□ -0.328e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MTERF2-207ENST00000552029 3235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.328e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RABGGTA-215ENST00000560207 678 ntTSL 313.06□□□□□ -0.328e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ZBED9-204ENST00000530247 755 ntTSL 213.06□□□□□ -0.328e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PPP2R1B-202ENST00000341980 1953 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.328e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.328e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.328e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PTK7-204ENST00000349241 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.328e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ZNF620-203ENST00000420891 533 ntTSL 313.05□□□□□ -0.328e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 DDX27-205ENST00000493252 825 ntTSL 313.05□□□□□ -0.328e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.328e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 DNASE1L1-204ENST00000369808 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)13.04□□□□□ -0.328e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 GSTM4-202ENST00000336075 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.328e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 GSTM4-213ENST00000638994 657 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.328e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.328e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ANKRD42-203ENST00000393392 2302 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.328e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 IGSF11-202ENST00000393775 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.328e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 GDPD5-202ENST00000443276 3106 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.328e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ABI1-212ENST00000490841 3188 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.338e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 DDX27-206ENST00000618172 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.338e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 LRRC8E-201ENST00000306708 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.338e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CLIC1-207ENST00000375780 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.338e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ECHDC1-209ENST00000454591 1515 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.338e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MGST1-213ENST00000539036 566 ntTSL 413□□□□□ -0.338e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 DNASE1L1-205ENST00000369809 3008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.338e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PAX6-207ENST00000379129 2614 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.338e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CYB5R3-206ENST00000438270 675 ntTSL 312.99□□□□□ -0.338e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 APEH-201ENST00000296456 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.338e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 EXOC7-203ENST00000357231 1924 ntTSL 1 (best)12.98□□□□□ -0.338e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MCAM-204ENST00000525586 4865 ntTSL 512.97□□□□□ -0.338e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 QARS-222ENST00000494838 959 ntTSL 312.97□□□□□ -0.338e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ALAS2-206ENST00000477869 582 ntTSL 512.97□□□□□ -0.338e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 HDAC4-202ENST00000430200 578 ntTSL 312.97□□□□□ -0.338e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 HNRNPUL1-206ENST00000594207 816 ntTSL 512.96□□□□□ -0.338e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 STRADA-203ENST00000375840 2209 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.348e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CELSR2-204ENST00000498157 3680 ntTSL 212.95□□□□□ -0.348e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CASP8-207ENST00000392263 1630 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.94□□□□□ -0.348e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 EP400-209ENST00000616136 3134 ntTSL 212.93□□□□□ -0.348e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.348e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.348e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 QARS-241ENST00000635375 947 ntTSL 312.91□□□□□ -0.348e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 KYAT3-201ENST00000260508 2070 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.348e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RAB5C-204ENST00000547517 1167 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.348e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 POLM-211ENST00000458246 3218 ntTSL 1 (best)12.9□□□□□ -0.348e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 FLOT2-203ENST00000465427 746 ntTSL 512.89□□□□□ -0.358e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AIMP2-203ENST00000400479 1107 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.358e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.358e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 U2AF1L4-211ENST00000588980 2018 ntTSL 212.86□□□□□ -0.358e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.358e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ZC3HC1-209ENST00000481503 1741 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.368e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AREL1-208ENST00000554070 742 ntTSL 312.83□□□□□ -0.368e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SPATS2L-208ENST00000409718 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.368e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.368e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 UXS1-204ENST00000416298 701 ntTSL 512.81□□□□□ -0.368e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 KIF1BP-207ENST00000635971 2079 ntTSL 512.81□□□□□ -0.368e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SLC36A1-201ENST00000243389 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.368e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 STRADA-205ENST00000447001 2014 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.368e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 LRRC8E-206ENST00000618098 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.368e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.368e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ZNF385A-204ENST00000546919 775 ntTSL 512.79□□□□□ -0.368e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 WASHC2A-201ENST00000282633 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.368e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ENOX2-201ENST00000338144 4263 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.368e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 WDR77-203ENST00000459665 637 ntTSL 312.78□□□□□ -0.368e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SPATS2L-205ENST00000409151 1979 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.368e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 IQGAP3-204ENST00000498755 803 ntTSL 212.77□□□□□ -0.378e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CTNND1-238ENST00000534647 866 ntTSL 512.77□□□□□ -0.378e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 FMNL1-202ENST00000331495 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.378e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PAX6-241ENST00000638853 1248 ntTSL 512.76□□□□□ -0.378e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ERH-202ENST00000555373 586 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.378e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 GPI-207ENST00000587521 557 ntTSL 512.75□□□□□ -0.378e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SIPA1L1-218ENST00000557712 1823 ntTSL 212.75□□□□□ -0.378e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CHEK1-201ENST00000278916 1712 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.378e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SNU13-201ENST00000215956 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.378e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 DNM3-206ENST00000520906 4454 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.378e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PAX6-232ENST00000638250 1483 ntTSL 512.73□□□□□ -0.378e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.378e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PRMT2-211ENST00000481861 1301 ntTSL 1 (best)12.72□□□□□ -0.378e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ELP4-224ENST00000640379 772 ntTSL 512.72□□□□□ -0.378e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TFEB-216ENST00000445700 223 ntTSL 1 (best)12.72□□□□□ -0.378e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RAD51-202ENST00000382643 1588 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.378e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 KPNA1-203ENST00000465882 1062 ntTSL 312.71□□□□□ -0.378e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ERGIC2-203ENST00000546839 1274 ntTSL 512.71□□□□□ -0.378e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ZFR-203ENST00000505204 552 ntTSL 412.7□□□□□ -0.388e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ANKRA2-202ENST00000504641 902 ntTSL 312.7□□□□□ -0.388e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RAB5C-203ENST00000546881 608 ntTSL 212.69□□□□□ -0.388e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PSMD13-206ENST00000527047 1284 ntTSL 1 (best)12.69□□□□□ -0.388e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 BAIAP2-223ENST00000575958 567 ntTSL 412.69□□□□□ -0.388e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 UHRF1-206ENST00000622802 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.388e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TRAPPC12-212ENST00000457845 579 ntTSL 412.67□□□□□ -0.388e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PAX6-261ENST00000639943 2584 ntTSL 512.67□□□□□ -0.388e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PAX6-258ENST00000639548 1417 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.388e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SMIM8-205ENST00000448282 1214 ntTSL 1 (best)12.65□□□□□ -0.388e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MCAM-208ENST00000528533 3164 ntTSL 512.65□□□□□ -0.388e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.388e-6■■■■■ 107
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