Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

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Length 899 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRRT4C9JH25 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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