Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms