Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
USP18Q9UMW8 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
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