Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKX1-2Q9UD57 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms