Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IFNKQ9P0W0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms