Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTA3Q9BTC8 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MTA3Q9BTC8 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTA3Q9BTC8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTA3Q9BTC8 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTA3Q9BTC8 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTA3Q9BTC8 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTA3Q9BTC8 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTA3Q9BTC8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTA3Q9BTC8 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTA3Q9BTC8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTA3Q9BTC8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTA3Q9BTC8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTA3Q9BTC8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTA3Q9BTC8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MTA3Q9BTC8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTA3Q9BTC8 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms