Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF1

GLIS1, Zinc finger protein GLIS1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1Q8NBF1 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GLIS1Q8NBF1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GLIS1Q8NBF1 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GLIS1Q8NBF1 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GLIS1Q8NBF1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GLIS1Q8NBF1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GLIS1Q8NBF1 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GLIS1Q8NBF1 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GLIS1Q8NBF1 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GLIS1Q8NBF1 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GLIS1Q8NBF1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GLIS1Q8NBF1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GLIS1Q8NBF1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GLIS1Q8NBF1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GLIS1Q8NBF1 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GLIS1Q8NBF1 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GLIS1Q8NBF1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GLIS1Q8NBF1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GLIS1Q8NBF1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GLIS1Q8NBF1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GLIS1Q8NBF1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GLIS1Q8NBF1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GLIS1Q8NBF1 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GLIS1Q8NBF1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GLIS1Q8NBF1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GLIS1Q8NBF1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GLIS1Q8NBF1 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GLIS1Q8NBF1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GLIS1Q8NBF1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GLIS1Q8NBF1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GLIS1Q8NBF1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GLIS1Q8NBF1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GLIS1Q8NBF1 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GLIS1Q8NBF1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GLIS1Q8NBF1 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GLIS1Q8NBF1 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GLIS1Q8NBF1 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms