Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMB4Q86W47 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMB4Q86W47 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms