Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRAMEF20Q5VT98 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms