Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMEM259Q4ZIN3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms