Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RTL8BQ17RB0 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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