Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CTF1Q16619 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CTF1Q16619 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CTF1Q16619 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CTF1Q16619 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CTF1Q16619 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CTF1Q16619 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CTF1Q16619 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CTF1Q16619 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CTF1Q16619 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTF1Q16619 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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